MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 5601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_021081	GT	3	6	705070	705075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021081	TGC	2	6	705097	705102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021081	CGC	2	6	705170	705175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_021081	TTC	2	6	707227	707232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_021081	GCG	2	6	710005	710010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_021081	CCTG	2	8	710022	710029	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_021081	AGCCA	2	10	710052	710061	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1509	NC_021081	AGG	2	6	710129	710134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021081	TGG	2	6	711383	711388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021081	CCGA	2	8	711456	711463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_021081	GTA	2	6	711485	711490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021081	AGCG	2	8	711508	711515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_021081	TAT	2	6	711532	711537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021081	CTT	2	6	711586	711591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_021081	AAG	2	6	711597	711602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021081	CAA	2	6	712993	712998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_021081	GAG	2	6	713023	713028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021081	GTT	2	6	713087	713092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021081	ACA	2	6	713112	713117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_021081	TGC	2	6	713172	713177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021081	C	6	6	715113	715118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1523	NC_021081	A	6	6	715158	715163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021081	TGC	2	6	716548	716553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_021081	TGC	2	6	717729	717734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_021081	GGTGG	2	10	717740	717749	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021081	ACC	2	6	717757	717762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1531	NC_021081	AG	3	6	717803	717808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021081	CCT	2	6	717845	717850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_021081	GGCCT	2	10	717929	717938	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1534	NC_021081	AGG	2	6	717964	717969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021081	GCCA	2	8	719700	719707	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_021081	CCAG	2	8	719718	719725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_021081	CCA	2	6	719746	719751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_021081	ACC	2	6	719798	719803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_021081	TTA	2	6	719834	719839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1541	NC_021081	GC	3	6	720013	720018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_021081	GTTGGC	2	12	720024	720035	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1543	NC_021081	ACC	2	6	720055	720060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_021081	CCT	2	6	720071	720076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_021081	CGG	2	6	721977	721982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_021081	TGCT	2	8	722018	722025	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_021081	GTTTGG	2	12	722047	722058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021081	GTG	2	6	722086	722091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021081	TGC	2	6	726840	726845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_021081	GGA	2	6	728640	728645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021081	TCC	2	6	728687	728692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_021081	CTATC	2	10	729588	729597	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1553	NC_021081	C	6	6	729823	729828	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1559	NC_021081	GCA	2	6	734174	734179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1561	NC_021081	G	6	6	734797	734802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021081	AGG	2	6	734845	734850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_021081	CAG	2	6	735085	735090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021081	CAG	2	6	735108	735113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1566	NC_021081	C	6	6	735148	735153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1567	NC_021081	C	6	6	735751	735756	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1568	NC_021081	G	6	6	735782	735787	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021081	TCT	2	6	735791	735796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1572	NC_021081	TTTG	2	8	735928	735935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1588	NC_021081	GGGCTG	2	12	743705	743716	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1589	NC_021081	TACA	2	8	743743	743750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_021081	AGATTT	2	12	743756	743767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_021081	TGA	2	6	751577	751582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_021081	GGT	2	6	752736	752741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021081	TAC	2	6	752769	752774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_021081	CTTC	2	8	752790	752797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_021081	A	6	6	752876	752881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021081	CCAG	2	8	754595	754602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_021081	GGC	2	6	756428	756433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1608	NC_021081	AT	3	6	756454	756459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021081	TTA	2	6	757434	757439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021081	GAT	2	6	757518	757523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1613	NC_021081	G	6	6	758895	758900	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021081	AGG	2	6	760885	760890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021081	GC	3	6	764804	764809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_021081	GAG	3	9	764817	764825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021081	GGCTT	2	10	764849	764858	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1619	NC_021081	C	6	6	765341	765346	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1620	NC_021081	A	7	7	765378	765384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021081	CGT	2	6	765687	765692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_021081	T	6	6	765791	765796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021081	GAG	2	6	767140	767145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021081	TG	3	6	767170	767175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021081	GGCT	2	8	768088	768095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_021081	CTC	2	6	772790	772795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_021081	A	7	7	773972	773978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_021081	GGCCG	2	10	775311	775320	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1629	NC_021081	GCT	2	6	775393	775398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_021081	GCC	2	6	775433	775438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_021081	AGC	2	6	775864	775869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_021081	C	7	7	775877	775883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1633	NC_021081	CCTG	2	8	775907	775914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_021081	GTG	2	6	775943	775948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1994	NC_021081	AGGCC	2	10	963578	963587	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1995	NC_021081	TCA	2	6	964413	964418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1999	NC_021081	G	6	6	967352	967357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_021081	AGC	2	6	967458	967463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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